Esta subespecie, de la cual se estima que solo quedan alrededor de mil ejemplares en estado salvaje, está clasificada como "en peligro", el segundo mayor nivel de amenaza antes de la extinción en estado salvaje.

La nueva lista de la UICN evalúa con distintos niveles de amenaza a 45.321 especies de animales y plantas, lo que representa el 27% del total estudiado (163.040). Entre estas, 863 especies tienen su hábitat en España. En la versión de 2024, más de 10.000 especies están en peligro crítico, el nivel máximo de amenaza: 10.031 en total, incluyendo 235 mamíferos, 232 aves, 430 reptiles, 799 anfibios, 867 peces, 435 insectos, 745 moluscos y 5.915 plantas. Esto representa un aumento significativo desde 1996, cuando solo 1.820 especies estaban en esta categoría.

El elefante de Borneo ha visto disminuir su población en los últimos 75 años, principalmente debido a la excesiva tala de bosques en la isla que comparten Indonesia, Malasia y Brunei. A esta causa se ha sumado la expansión de la población humana, que ha incrementado la caza de elefantes por parte de los habitantes locales, a veces como represalia por la destrucción de cultivos. Además, la expansión de cultivos agrícolas, como el aceite de palma, el tráfico ilegal de marfil y la construcción de carreteras, han contribuido significativamente a la reducción de esta especie.

La UICN subraya la urgencia de tomar medidas para proteger al elefante de Borneo y otras especies en peligro crítico. La conservación de su hábitat, la regulación de la caza y el control del tráfico de marfil son esenciales para garantizar la supervivencia de estas especies. La actualización de la Lista Roja busca concienciar sobre la importancia de la conservación y la necesidad de acciones inmediatas para proteger la biodiversidad global.